Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPPLY3P57055 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPPLY3P57055 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPPLY3P57055 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPPLY3P57055 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPPLY3P57055 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPPLY3P57055 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPPLY3P57055 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPPLY3P57055 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPPLY3P57055 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPPLY3P57055 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPPLY3P57055 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPPLY3P57055 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPPLY3P57055 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY3P57055 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY3P57055 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY3P57055 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPPLY3P57055 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPPLY3P57055 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPPLY3P57055 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPPLY3P57055 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPPLY3P57055 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPPLY3P57055 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPPLY3P57055 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPPLY3P57055 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPPLY3P57055 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPPLY3P57055 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPPLY3P57055 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPPLY3P57055 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPPLY3P57055 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPPLY3P57055 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPPLY3P57055 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPPLY3P57055 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPPLY3P57055 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPPLY3P57055 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPPLY3P57055 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPPLY3P57055 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPPLY3P57055 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPPLY3P57055 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPPLY3P57055 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPPLY3P57055 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPPLY3P57055 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPPLY3P57055 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPPLY3P57055 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPPLY3P57055 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPPLY3P57055 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPPLY3P57055 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPPLY3P57055 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPPLY3P57055 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPPLY3P57055 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPPLY3P57055 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPPLY3P57055 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPPLY3P57055 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPPLY3P57055 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPPLY3P57055 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPPLY3P57055 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPPLY3P57055 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPPLY3P57055 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPPLY3P57055 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPPLY3P57055 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPPLY3P57055 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPPLY3P57055 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPPLY3P57055 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPPLY3P57055 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPPLY3P57055 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPPLY3P57055 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPPLY3P57055 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPPLY3P57055 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPPLY3P57055 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPPLY3P57055 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPPLY3P57055 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPPLY3P57055 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPPLY3P57055 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPPLY3P57055 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPPLY3P57055 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPPLY3P57055 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPPLY3P57055 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPPLY3P57055 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPPLY3P57055 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPPLY3P57055 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPPLY3P57055 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPPLY3P57055 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPPLY3P57055 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPPLY3P57055 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPPLY3P57055 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPPLY3P57055 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIPPLY3P57055 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIPPLY3P57055 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIPPLY3P57055 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIPPLY3P57055 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIPPLY3P57055 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIPPLY3P57055 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPPLY3P57055 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPPLY3P57055 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPPLY3P57055 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPPLY3P57055 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPPLY3P57055 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPPLY3P57055 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPPLY3P57055 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPPLY3P57055 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms