Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH15P55291 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH15P55291 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH15P55291 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH15P55291 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH15P55291 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH15P55291 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH15P55291 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH15P55291 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH15P55291 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH15P55291 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH15P55291 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH15P55291 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH15P55291 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDH15P55291 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDH15P55291 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH15P55291 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH15P55291 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH15P55291 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH15P55291 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH15P55291 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH15P55291 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH15P55291 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH15P55291 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH15P55291 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH15P55291 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH15P55291 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH15P55291 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH15P55291 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH15P55291 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH15P55291 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH15P55291 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH15P55291 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH15P55291 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH15P55291 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH15P55291 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH15P55291 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH15P55291 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH15P55291 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH15P55291 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH15P55291 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH15P55291 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH15P55291 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH15P55291 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH15P55291 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH15P55291 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH15P55291 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH15P55291 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH15P55291 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH15P55291 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH15P55291 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH15P55291 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH15P55291 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH15P55291 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH15P55291 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH15P55291 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH15P55291 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH15P55291 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH15P55291 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH15P55291 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH15P55291 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH15P55291 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH15P55291 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH15P55291 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH15P55291 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH15P55291 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH15P55291 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH15P55291 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH15P55291 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH15P55291 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH15P55291 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH15P55291 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH15P55291 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH15P55291 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH15P55291 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH15P55291 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH15P55291 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH15P55291 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH15P55291 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH15P55291 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH15P55291 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH15P55291 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH15P55291 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH15P55291 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH15P55291 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH15P55291 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH15P55291 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH15P55291 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH15P55291 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH15P55291 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH15P55291 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH15P55291 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH15P55291 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH15P55291 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH15P55291 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH15P55291 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH15P55291 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH15P55291 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH15P55291 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH15P55291 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms