Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RORCP51449 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RORCP51449 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RORCP51449 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RORCP51449 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RORCP51449 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RORCP51449 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RORCP51449 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RORCP51449 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RORCP51449 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RORCP51449 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RORCP51449 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RORCP51449 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RORCP51449 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RORCP51449 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RORCP51449 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RORCP51449 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RORCP51449 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RORCP51449 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RORCP51449 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RORCP51449 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RORCP51449 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RORCP51449 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RORCP51449 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RORCP51449 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RORCP51449 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RORCP51449 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RORCP51449 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RORCP51449 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RORCP51449 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RORCP51449 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RORCP51449 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RORCP51449 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RORCP51449 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RORCP51449 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RORCP51449 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RORCP51449 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RORCP51449 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RORCP51449 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RORCP51449 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RORCP51449 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RORCP51449 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RORCP51449 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RORCP51449 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RORCP51449 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RORCP51449 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RORCP51449 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RORCP51449 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RORCP51449 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RORCP51449 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RORCP51449 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RORCP51449 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RORCP51449 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RORCP51449 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RORCP51449 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RORCP51449 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RORCP51449 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RORCP51449 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RORCP51449 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RORCP51449 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RORCP51449 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RORCP51449 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RORCP51449 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RORCP51449 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RORCP51449 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RORCP51449 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RORCP51449 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RORCP51449 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RORCP51449 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RORCP51449 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RORCP51449 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RORCP51449 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RORCP51449 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RORCP51449 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RORCP51449 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RORCP51449 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RORCP51449 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RORCP51449 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RORCP51449 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RORCP51449 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RORCP51449 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RORCP51449 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RORCP51449 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RORCP51449 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RORCP51449 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RORCP51449 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RORCP51449 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RORCP51449 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RORCP51449 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RORCP51449 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RORCP51449 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RORCP51449 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RORCP51449 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RORCP51449 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RORCP51449 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RORCP51449 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RORCP51449 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RORCP51449 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RORCP51449 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RORCP51449 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms