Protein–RNA interactions for Protein: P48052

CPA2, Carboxypeptidase A2, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA2P48052 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPA2P48052 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA2P48052 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CPA2P48052 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPA2P48052 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPA2P48052 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPA2P48052 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPA2P48052 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPA2P48052 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPA2P48052 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPA2P48052 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPA2P48052 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPA2P48052 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPA2P48052 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CPA2P48052 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPA2P48052 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPA2P48052 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPA2P48052 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPA2P48052 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPA2P48052 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CPA2P48052 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CPA2P48052 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CPA2P48052 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CPA2P48052 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CPA2P48052 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CPA2P48052 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CPA2P48052 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CPA2P48052 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CPA2P48052 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CPA2P48052 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CPA2P48052 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CPA2P48052 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPA2P48052 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CPA2P48052 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPA2P48052 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPA2P48052 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPA2P48052 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPA2P48052 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPA2P48052 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPA2P48052 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA2P48052 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA2P48052 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA2P48052 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA2P48052 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA2P48052 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPA2P48052 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPA2P48052 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPA2P48052 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPA2P48052 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPA2P48052 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CPA2P48052 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPA2P48052 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA2P48052 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA2P48052 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA2P48052 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA2P48052 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA2P48052 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA2P48052 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA2P48052 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA2P48052 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA2P48052 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA2P48052 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA2P48052 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA2P48052 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA2P48052 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA2P48052 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA2P48052 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA2P48052 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA2P48052 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA2P48052 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA2P48052 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA2P48052 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA2P48052 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA2P48052 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA2P48052 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA2P48052 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA2P48052 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA2P48052 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA2P48052 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA2P48052 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA2P48052 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA2P48052 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA2P48052 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA2P48052 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA2P48052 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA2P48052 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA2P48052 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA2P48052 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPA2P48052 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPA2P48052 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPA2P48052 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CPA2P48052 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPA2P48052 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPA2P48052 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA2P48052 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA2P48052 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA2P48052 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA2P48052 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA2P48052 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA2P48052 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms