Protein–RNA interactions for Protein: P36534

MRPL40, 54S ribosomal protein L40, mitochondrial, yeastyeast

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MRPL40P36534 SHH4YLR164W 507 nt10.11□□□□□ -0.79
MRPL40P36534 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.11□□□□□ -0.79
MRPL40P36534 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.11□□□□□ -0.79
MRPL40P36534 LSC2YGR244C 1284 nt10.1□□□□□ -0.79
MRPL40P36534 FUR4YBR021W 1902 nt10.08□□□□□ -0.8
MRPL40P36534 YML089CYML089C 369 nt10.08□□□□□ -0.8
MRPL40P36534 NAR1YNL240C 1476 nt10.07□□□□□ -0.8
MRPL40P36534 UTH1YKR042W 1098 nt10.07□□□□□ -0.8
MRPL40P36534 POM34YLR018C 900 nt10.07□□□□□ -0.8
MRPL40P36534 HSP60YLR259C 1719 nt10.05□□□□□ -0.8
MRPL40P36534 RPS14BYJL191W 417 nt10.05□□□□□ -0.8
MRPL40P36534 YLR111WYLR111W 333 nt10.05□□□□□ -0.8
MRPL40P36534 TOM6YOR045W 186 nt10.05□□□□□ -0.8
MRPL40P36534 RTN2YDL204W 1182 nt10.03□□□□□ -0.8
MRPL40P36534 ARP6YLR085C 1317 nt10.03□□□□□ -0.8
MRPL40P36534 PRO1YDR300C 1287 nt10.02□□□□□ -0.81
MRPL40P36534 SDH5YOL071W 489 nt10.02□□□□□ -0.81
MRPL40P36534 HIP1YGR191W 1812 nt10.01□□□□□ -0.81
MRPL40P36534 CMP2YML057W 1815 nt10□□□□□ -0.81
MRPL40P36534 PEX2YJL210W 816 nt10□□□□□ -0.81
MRPL40P36534 ATG15YCR068W 1563 nt10□□□□□ -0.81
MRPL40P36534 HSL7YBR133C 2484 nt9.99□□□□□ -0.81
MRPL40P36534 NRT1YOR071C 1797 nt9.98□□□□□ -0.81
MRPL40P36534 MET2YNL277W 1461 nt9.98□□□□□ -0.81
MRPL40P36534 HEL2YDR266C 1920 nt9.98□□□□□ -0.81
MRPL40P36534 FRE6YLL051C 2139 nt9.98□□□□□ -0.81
MRPL40P36534 MET28YIR017C 564 nt9.97□□□□□ -0.81
MRPL40P36534 SAM1YLR180W 1149 nt9.97□□□□□ -0.81
MRPL40P36534 TSC10YBR265W 963 nt9.97□□□□□ -0.81
MRPL40P36534 RAD23YEL037C 1197 nt9.96□□□□□ -0.82
MRPL40P36534 TIF6YPR016C 738 nt9.96□□□□□ -0.82
MRPL40P36534 SSN3YPL042C 1668 nt9.96□□□□□ -0.82
MRPL40P36534 GAP1YKR039W 1809 nt9.93□□□□□ -0.82
MRPL40P36534 YKR005CYKR005C 1578 nt9.91□□□□□ -0.82
MRPL40P36534 GID7YCL039W 2238 nt9.9□□□□□ -0.82
MRPL40P36534 YGR012WYGR012W 1182 nt9.9□□□□□ -0.82
MRPL40P36534 YGR259CYGR259C 441 nt9.9□□□□□ -0.82
MRPL40P36534 FIT3YOR383C 615 nt9.9□□□□□ -0.82
MRPL40P36534 YAT1YAR035W 2064 nt9.9□□□□□ -0.82
MRPL40P36534 PLB1YMR008C 1995 nt9.9□□□□□ -0.83
MRPL40P36534 PRP4YPR178W 1398 nt9.85□□□□□ -0.83
MRPL40P36534 BMT6YLR063W 1098 nt9.84□□□□□ -0.83
MRPL40P36534 RIB3YDR487C 627 nt9.83□□□□□ -0.84
MRPL40P36534 YLR279WYLR279W 390 nt9.83□□□□□ -0.84
MRPL40P36534 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.82□□□□□ -0.84
MRPL40P36534 SFP1YLR403W 2052 nt9.82□□□□□ -0.84
MRPL40P36534 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.82□□□□□ -0.84
MRPL40P36534 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.82□□□□□ -0.84
MRPL40P36534 YAR028WYAR028W 705 nt9.79□□□□□ -0.84
MRPL40P36534 DIF1YLR437C 402 nt9.79□□□□□ -0.84
MRPL40P36534 DPS1YLL018C 1674 nt9.77□□□□□ -0.84
MRPL40P36534 UTR1YJR049C 1593 nt9.77□□□□□ -0.85
MRPL40P36534 MSB4YOL112W 1479 nt9.77□□□□□ -0.85
MRPL40P36534 NPP1YCR026C 2229 nt9.76□□□□□ -0.85
MRPL40P36534 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.76□□□□□ -0.85
MRPL40P36534 CAB5YDR196C 726 nt9.75□□□□□ -0.85
MRPL40P36534 SAM35YHR083W 990 nt9.75□□□□□ -0.85
MRPL40P36534 ALP1YNL270C 1722 nt9.74□□□□□ -0.85
MRPL40P36534 IRC24YIR036C 792 nt9.72□□□□□ -0.85
MRPL40P36534 AKR2YOR034C 2250 nt9.71□□□□□ -0.85
MRPL40P36534 MTG2YHR168W 1557 nt9.69□□□□□ -0.86
MRPL40P36534 CYT2YKL087C 675 nt9.68□□□□□ -0.86
MRPL40P36534 STE4YOR212W 1272 nt9.68□□□□□ -0.86
MRPL40P36534 ZTA1YBR046C 1005 nt9.68□□□□□ -0.86
MRPL40P36534 AAC1YMR056C 930 nt9.66□□□□□ -0.86
MRPL40P36534 RAD51YER095W 1203 nt9.65□□□□□ -0.86
MRPL40P36534 YPI1YFR003C 468 nt9.65□□□□□ -0.86
MRPL40P36534 PRM5YIL117C 957 nt9.65□□□□□ -0.86
MRPL40P36534 GND1YHR183W 1470 nt9.65□□□□□ -0.87
MRPL40P36534 SED1YDR077W 1017 nt9.63□□□□□ -0.87
MRPL40P36534 YJL195CYJL195C 702 nt9.63□□□□□ -0.87
MRPL40P36534 LOT5YKL183W 921 nt9.63□□□□□ -0.87
MRPL40P36534 FUN14YAL008W 597 nt9.62□□□□□ -0.87
MRPL40P36534 YNR029CYNR029C 1290 nt9.61□□□□□ -0.87
MRPL40P36534 ADH7YCR105W 1086 nt9.59□□□□□ -0.87
MRPL40P36534 ADH1YOL086C 1047 nt9.58□□□□□ -0.88
MRPL40P36534 FCY21YER060W 1587 nt9.58□□□□□ -0.88
MRPL40P36534 PBP1YGR178C 2169 nt9.57□□□□□ -0.88
MRPL40P36534 YLR349WYLR349W 507 nt9.57□□□□□ -0.88
MRPL40P36534 ALD4YOR374W 1560 nt9.57□□□□□ -0.88
MRPL40P36534 APT2YDR441C 546 nt9.56□□□□□ -0.88
MRPL40P36534 PAU15YIR041W 375 nt9.56□□□□□ -0.88
MRPL40P36534 LIP1YMR298W 453 nt9.56□□□□□ -0.88
MRPL40P36534 SNF1YDR477W 1902 nt9.56□□□□□ -0.88
MRPL40P36534 SMM1YNR015W 1155 nt9.55□□□□□ -0.88
MRPL40P36534 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.54□□□□□ -0.88
MRPL40P36534 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.54□□□□□ -0.88
MRPL40P36534 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.54□□□□□ -0.88
MRPL40P36534 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.54□□□□□ -0.88
MRPL40P36534 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.54□□□□□ -0.88
MRPL40P36534 ESBP6YNL125C 2022 nt9.54□□□□□ -0.88
MRPL40P36534 MAE1YKL029C 2010 nt9.53□□□□□ -0.88
MRPL40P36534 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.51□□□□□ -0.89
MRPL40P36534 DBP1YPL119C 1854 nt9.51□□□□□ -0.89
MRPL40P36534 TPO4YOR273C 1980 nt9.51□□□□□ -0.89
MRPL40P36534 ILV2YMR108W 2064 nt9.51□□□□□ -0.89
MRPL40P36534 HXT1YHR094C 1713 nt9.51□□□□□ -0.89
MRPL40P36534 BSP1YPR171W 1731 nt9.49□□□□□ -0.89
MRPL40P36534 HMG2YLR450W 3138 nt9.49□□□□□ -0.89
MRPL40P36534 UGA4YDL210W 1716 nt9.48□□□□□ -0.89
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