Protein–RNA interactions for Protein: P34741

SDC2, Syndecan-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC2P34741 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDC2P34741 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDC2P34741 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDC2P34741 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDC2P34741 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDC2P34741 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDC2P34741 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDC2P34741 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDC2P34741 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDC2P34741 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDC2P34741 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDC2P34741 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDC2P34741 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDC2P34741 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDC2P34741 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDC2P34741 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDC2P34741 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDC2P34741 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDC2P34741 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDC2P34741 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SDC2P34741 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDC2P34741 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDC2P34741 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDC2P34741 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDC2P34741 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDC2P34741 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDC2P34741 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDC2P34741 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDC2P34741 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDC2P34741 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDC2P34741 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDC2P34741 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDC2P34741 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDC2P34741 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDC2P34741 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDC2P34741 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDC2P34741 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDC2P34741 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDC2P34741 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDC2P34741 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDC2P34741 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDC2P34741 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDC2P34741 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDC2P34741 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDC2P34741 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDC2P34741 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDC2P34741 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDC2P34741 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDC2P34741 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDC2P34741 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDC2P34741 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDC2P34741 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDC2P34741 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDC2P34741 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDC2P34741 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDC2P34741 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDC2P34741 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SDC2P34741 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDC2P34741 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDC2P34741 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDC2P34741 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDC2P34741 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDC2P34741 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDC2P34741 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDC2P34741 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDC2P34741 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDC2P34741 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDC2P34741 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDC2P34741 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDC2P34741 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDC2P34741 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDC2P34741 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDC2P34741 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDC2P34741 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDC2P34741 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDC2P34741 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDC2P34741 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDC2P34741 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDC2P34741 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDC2P34741 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDC2P34741 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDC2P34741 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDC2P34741 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDC2P34741 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDC2P34741 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDC2P34741 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDC2P34741 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDC2P34741 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDC2P34741 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDC2P34741 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDC2P34741 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDC2P34741 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDC2P34741 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDC2P34741 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDC2P34741 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDC2P34741 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDC2P34741 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDC2P34741 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDC2P34741 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SDC2P34741 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms