Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF4P18848 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF4P18848 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF4P18848 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF4P18848 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF4P18848 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF4P18848 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF4P18848 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF4P18848 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF4P18848 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF4P18848 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF4P18848 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF4P18848 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF4P18848 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF4P18848 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF4P18848 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF4P18848 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF4P18848 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATF4P18848 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF4P18848 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF4P18848 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF4P18848 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF4P18848 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF4P18848 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF4P18848 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF4P18848 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF4P18848 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF4P18848 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF4P18848 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF4P18848 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF4P18848 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF4P18848 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF4P18848 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF4P18848 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF4P18848 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF4P18848 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF4P18848 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF4P18848 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF4P18848 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF4P18848 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF4P18848 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF4P18848 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF4P18848 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF4P18848 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF4P18848 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF4P18848 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF4P18848 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF4P18848 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF4P18848 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF4P18848 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF4P18848 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF4P18848 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF4P18848 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF4P18848 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF4P18848 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF4P18848 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF4P18848 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF4P18848 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF4P18848 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF4P18848 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF4P18848 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF4P18848 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF4P18848 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF4P18848 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF4P18848 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF4P18848 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF4P18848 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF4P18848 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF4P18848 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF4P18848 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF4P18848 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF4P18848 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF4P18848 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF4P18848 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF4P18848 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF4P18848 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF4P18848 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF4P18848 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF4P18848 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF4P18848 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF4P18848 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF4P18848 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF4P18848 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF4P18848 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF4P18848 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF4P18848 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF4P18848 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF4P18848 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF4P18848 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF4P18848 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF4P18848 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF4P18848 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF4P18848 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF4P18848 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF4P18848 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF4P18848 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF4P18848 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF4P18848 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF4P18848 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF4P18848 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms