Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRB1P18505 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRB1P18505 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRB1P18505 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRB1P18505 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRB1P18505 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRB1P18505 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRB1P18505 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRB1P18505 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRB1P18505 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRB1P18505 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRB1P18505 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRB1P18505 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRB1P18505 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRB1P18505 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRB1P18505 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRB1P18505 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRB1P18505 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRB1P18505 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRB1P18505 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRB1P18505 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRB1P18505 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRB1P18505 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRB1P18505 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRB1P18505 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRB1P18505 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRB1P18505 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRB1P18505 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRB1P18505 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRB1P18505 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRB1P18505 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRB1P18505 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRB1P18505 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRB1P18505 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRB1P18505 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRB1P18505 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRB1P18505 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRB1P18505 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRB1P18505 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRB1P18505 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRB1P18505 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRB1P18505 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRB1P18505 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRB1P18505 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRB1P18505 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRB1P18505 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRB1P18505 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRB1P18505 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRB1P18505 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRB1P18505 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB1P18505 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB1P18505 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB1P18505 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB1P18505 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB1P18505 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRB1P18505 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRB1P18505 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRB1P18505 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRB1P18505 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRB1P18505 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRB1P18505 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRB1P18505 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRB1P18505 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRB1P18505 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRB1P18505 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRB1P18505 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRB1P18505 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRB1P18505 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRB1P18505 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRB1P18505 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GABRB1P18505 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRB1P18505 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRB1P18505 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRB1P18505 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRB1P18505 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRB1P18505 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB1P18505 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB1P18505 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB1P18505 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB1P18505 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRB1P18505 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRB1P18505 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRB1P18505 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRB1P18505 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRB1P18505 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRB1P18505 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms