Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXB3P14651 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXB3P14651 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXB3P14651 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXB3P14651 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXB3P14651 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXB3P14651 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB3P14651 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB3P14651 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB3P14651 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB3P14651 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB3P14651 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB3P14651 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB3P14651 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB3P14651 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB3P14651 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB3P14651 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXB3P14651 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB3P14651 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB3P14651 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB3P14651 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB3P14651 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB3P14651 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB3P14651 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB3P14651 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB3P14651 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB3P14651 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB3P14651 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXB3P14651 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB3P14651 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB3P14651 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB3P14651 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB3P14651 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB3P14651 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB3P14651 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB3P14651 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB3P14651 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB3P14651 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB3P14651 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB3P14651 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB3P14651 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB3P14651 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB3P14651 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB3P14651 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB3P14651 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB3P14651 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXB3P14651 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXB3P14651 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXB3P14651 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB3P14651 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB3P14651 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB3P14651 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB3P14651 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB3P14651 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXB3P14651 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXB3P14651 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXB3P14651 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXB3P14651 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXB3P14651 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB3P14651 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXB3P14651 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXB3P14651 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXB3P14651 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB3P14651 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB3P14651 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB3P14651 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB3P14651 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB3P14651 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB3P14651 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB3P14651 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB3P14651 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB3P14651 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB3P14651 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB3P14651 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB3P14651 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB3P14651 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB3P14651 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB3P14651 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB3P14651 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB3P14651 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB3P14651 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB3P14651 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB3P14651 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB3P14651 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXB3P14651 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXB3P14651 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB3P14651 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB3P14651 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB3P14651 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB3P14651 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB3P14651 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB3P14651 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB3P14651 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB3P14651 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXB3P14651 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXB3P14651 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXB3P14651 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB3P14651 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB3P14651 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB3P14651 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms