Protein–RNA interactions for Protein: P12757

SKIL, Ski-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKILP12757 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SKILP12757 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SKILP12757 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SKILP12757 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SKILP12757 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SKILP12757 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SKILP12757 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SKILP12757 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SKILP12757 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SKILP12757 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SKILP12757 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SKILP12757 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SKILP12757 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SKILP12757 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SKILP12757 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SKILP12757 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SKILP12757 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SKILP12757 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SKILP12757 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SKILP12757 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SKILP12757 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SKILP12757 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SKILP12757 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SKILP12757 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SKILP12757 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SKILP12757 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SKILP12757 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SKILP12757 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SKILP12757 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SKILP12757 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SKILP12757 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SKILP12757 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SKILP12757 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SKILP12757 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SKILP12757 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SKILP12757 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SKILP12757 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SKILP12757 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SKILP12757 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SKILP12757 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SKILP12757 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SKILP12757 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SKILP12757 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SKILP12757 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SKILP12757 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SKILP12757 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SKILP12757 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SKILP12757 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SKILP12757 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SKILP12757 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SKILP12757 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SKILP12757 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SKILP12757 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SKILP12757 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SKILP12757 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SKILP12757 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SKILP12757 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SKILP12757 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SKILP12757 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SKILP12757 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SKILP12757 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SKILP12757 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SKILP12757 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SKILP12757 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SKILP12757 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SKILP12757 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SKILP12757 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SKILP12757 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SKILP12757 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SKILP12757 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SKILP12757 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SKILP12757 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SKILP12757 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SKILP12757 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SKILP12757 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SKILP12757 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SKILP12757 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SKILP12757 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SKILP12757 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SKILP12757 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SKILP12757 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SKILP12757 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SKILP12757 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SKILP12757 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SKILP12757 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SKILP12757 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SKILP12757 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SKILP12757 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SKILP12757 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SKILP12757 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SKILP12757 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SKILP12757 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SKILP12757 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SKILP12757 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SKILP12757 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SKILP12757 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SKILP12757 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SKILP12757 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SKILP12757 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SKILP12757 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms