Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RD3LP0DJH9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3LP0DJH9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3LP0DJH9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3LP0DJH9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RD3LP0DJH9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3LP0DJH9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3LP0DJH9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RD3LP0DJH9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RD3LP0DJH9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RD3LP0DJH9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RD3LP0DJH9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RD3LP0DJH9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RD3LP0DJH9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RD3LP0DJH9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3LP0DJH9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3LP0DJH9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RD3LP0DJH9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RD3LP0DJH9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RD3LP0DJH9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RD3LP0DJH9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RD3LP0DJH9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RD3LP0DJH9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RD3LP0DJH9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RD3LP0DJH9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RD3LP0DJH9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RD3LP0DJH9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RD3LP0DJH9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RD3LP0DJH9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RD3LP0DJH9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RD3LP0DJH9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RD3LP0DJH9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RD3LP0DJH9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RD3LP0DJH9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RD3LP0DJH9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RD3LP0DJH9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RD3LP0DJH9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RD3LP0DJH9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RD3LP0DJH9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3LP0DJH9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3LP0DJH9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3LP0DJH9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RD3LP0DJH9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RD3LP0DJH9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RD3LP0DJH9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RD3LP0DJH9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RD3LP0DJH9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RD3LP0DJH9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RD3LP0DJH9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RD3LP0DJH9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RD3LP0DJH9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RD3LP0DJH9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RD3LP0DJH9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RD3LP0DJH9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RD3LP0DJH9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3LP0DJH9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3LP0DJH9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3LP0DJH9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RD3LP0DJH9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RD3LP0DJH9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RD3LP0DJH9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RD3LP0DJH9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RD3LP0DJH9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RD3LP0DJH9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RD3LP0DJH9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RD3LP0DJH9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RD3LP0DJH9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RD3LP0DJH9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RD3LP0DJH9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RD3LP0DJH9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RD3LP0DJH9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RD3LP0DJH9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RD3LP0DJH9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RD3LP0DJH9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RD3LP0DJH9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RD3LP0DJH9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RD3LP0DJH9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RD3LP0DJH9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RD3LP0DJH9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RD3LP0DJH9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3LP0DJH9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3LP0DJH9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RD3LP0DJH9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RD3LP0DJH9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RD3LP0DJH9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RD3LP0DJH9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RD3LP0DJH9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RD3LP0DJH9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RD3LP0DJH9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RD3LP0DJH9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RD3LP0DJH9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RD3LP0DJH9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RD3LP0DJH9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3LP0DJH9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3LP0DJH9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3LP0DJH9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3LP0DJH9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3LP0DJH9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3LP0DJH9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RD3LP0DJH9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms