Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC2BP0DI82 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC2BP0DI82 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC2BP0DI82 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC2BP0DI82 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC2BP0DI82 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC2BP0DI82 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC2BP0DI82 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC2BP0DI82 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC2BP0DI82 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAPPC2BP0DI82 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC2BP0DI82 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC2BP0DI82 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC2BP0DI82 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC2BP0DI82 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC2BP0DI82 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC2BP0DI82 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC2BP0DI82 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC2BP0DI82 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC2BP0DI82 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC2BP0DI82 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC2BP0DI82 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC2BP0DI82 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC2BP0DI82 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC2BP0DI82 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC2BP0DI82 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC2BP0DI82 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC2BP0DI82 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC2BP0DI82 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC2BP0DI82 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC2BP0DI82 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC2BP0DI82 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC2BP0DI82 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC2BP0DI82 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC2BP0DI82 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC2BP0DI82 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC2BP0DI82 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC2BP0DI82 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC2BP0DI82 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC2BP0DI82 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC2BP0DI82 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC2BP0DI82 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC2BP0DI82 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC2BP0DI82 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC2BP0DI82 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC2BP0DI82 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC2BP0DI82 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC2BP0DI82 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC2BP0DI82 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC2BP0DI82 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC2BP0DI82 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC2BP0DI82 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC2BP0DI82 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC2BP0DI82 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRAPPC2BP0DI82 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC2BP0DI82 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC2BP0DI82 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC2BP0DI82 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC2BP0DI82 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC2BP0DI82 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC2BP0DI82 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC2BP0DI82 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC2BP0DI82 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC2BP0DI82 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC2BP0DI82 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC2BP0DI82 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC2BP0DI82 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC2BP0DI82 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC2BP0DI82 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC2BP0DI82 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC2BP0DI82 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC2BP0DI82 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC2BP0DI82 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC2BP0DI82 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC2BP0DI82 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC2BP0DI82 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC2BP0DI82 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC2BP0DI82 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC2BP0DI82 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC2BP0DI82 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC2BP0DI82 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC2BP0DI82 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC2BP0DI82 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC2BP0DI82 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC2BP0DI82 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC2BP0DI82 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC2BP0DI82 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC2BP0DI82 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC2BP0DI82 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC2BP0DI82 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC2BP0DI82 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC2BP0DI82 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC2BP0DI82 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC2BP0DI82 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC2BP0DI82 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC2BP0DI82 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC2BP0DI82 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms