Protein–RNA interactions for Protein: P07358

C8B, Complement component C8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8BP07358 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C8BP07358 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C8BP07358 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C8BP07358 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C8BP07358 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C8BP07358 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C8BP07358 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C8BP07358 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C8BP07358 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C8BP07358 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C8BP07358 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C8BP07358 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C8BP07358 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C8BP07358 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C8BP07358 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C8BP07358 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C8BP07358 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C8BP07358 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C8BP07358 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C8BP07358 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
C8BP07358 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C8BP07358 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C8BP07358 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C8BP07358 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C8BP07358 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C8BP07358 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8BP07358 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8BP07358 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8BP07358 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8BP07358 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C8BP07358 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C8BP07358 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C8BP07358 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C8BP07358 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C8BP07358 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C8BP07358 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C8BP07358 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C8BP07358 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8BP07358 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8BP07358 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8BP07358 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8BP07358 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C8BP07358 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C8BP07358 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8BP07358 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8BP07358 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8BP07358 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8BP07358 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8BP07358 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C8BP07358 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C8BP07358 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C8BP07358 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
C8BP07358 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C8BP07358 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C8BP07358 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C8BP07358 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C8BP07358 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8BP07358 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8BP07358 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C8BP07358 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C8BP07358 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C8BP07358 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8BP07358 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C8BP07358 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C8BP07358 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
C8BP07358 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C8BP07358 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C8BP07358 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C8BP07358 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C8BP07358 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C8BP07358 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8BP07358 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8BP07358 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8BP07358 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8BP07358 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C8BP07358 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C8BP07358 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C8BP07358 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C8BP07358 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C8BP07358 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C8BP07358 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C8BP07358 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C8BP07358 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C8BP07358 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C8BP07358 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C8BP07358 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C8BP07358 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C8BP07358 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C8BP07358 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C8BP07358 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C8BP07358 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C8BP07358 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C8BP07358 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C8BP07358 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
C8BP07358 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C8BP07358 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C8BP07358 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C8BP07358 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C8BP07358 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C8BP07358 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms