Protein–RNA interactions for Protein: P04746

AMY2A, Pancreatic alpha-amylase, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2AP04746 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMY2AP04746 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMY2AP04746 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMY2AP04746 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMY2AP04746 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMY2AP04746 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMY2AP04746 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMY2AP04746 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMY2AP04746 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMY2AP04746 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AMY2AP04746 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
AMY2AP04746 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMY2AP04746 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMY2AP04746 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMY2AP04746 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMY2AP04746 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AMY2AP04746 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMY2AP04746 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMY2AP04746 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMY2AP04746 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMY2AP04746 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMY2AP04746 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AMY2AP04746 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AMY2AP04746 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMY2AP04746 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMY2AP04746 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMY2AP04746 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMY2AP04746 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMY2AP04746 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMY2AP04746 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMY2AP04746 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AMY2AP04746 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMY2AP04746 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMY2AP04746 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMY2AP04746 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMY2AP04746 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMY2AP04746 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AMY2AP04746 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AMY2AP04746 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMY2AP04746 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMY2AP04746 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMY2AP04746 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMY2AP04746 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMY2AP04746 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMY2AP04746 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMY2AP04746 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMY2AP04746 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMY2AP04746 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMY2AP04746 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AMY2AP04746 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMY2AP04746 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMY2AP04746 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMY2AP04746 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMY2AP04746 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMY2AP04746 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMY2AP04746 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMY2AP04746 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMY2AP04746 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMY2AP04746 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMY2AP04746 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMY2AP04746 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMY2AP04746 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMY2AP04746 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AMY2AP04746 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMY2AP04746 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMY2AP04746 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMY2AP04746 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMY2AP04746 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AMY2AP04746 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AMY2AP04746 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AMY2AP04746 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMY2AP04746 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMY2AP04746 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMY2AP04746 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AMY2AP04746 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMY2AP04746 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMY2AP04746 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMY2AP04746 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
AMY2AP04746 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMY2AP04746 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMY2AP04746 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms