Protein–RNA interactions for Protein: P03905

MT-ND4, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND4P03905 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MT-ND4P03905 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MT-ND4P03905 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MT-ND4P03905 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MT-ND4P03905 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MT-ND4P03905 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MT-ND4P03905 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MT-ND4P03905 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MT-ND4P03905 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MT-ND4P03905 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MT-ND4P03905 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MT-ND4P03905 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MT-ND4P03905 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MT-ND4P03905 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MT-ND4P03905 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MT-ND4P03905 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MT-ND4P03905 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MT-ND4P03905 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MT-ND4P03905 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MT-ND4P03905 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MT-ND4P03905 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MT-ND4P03905 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MT-ND4P03905 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MT-ND4P03905 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MT-ND4P03905 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MT-ND4P03905 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MT-ND4P03905 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MT-ND4P03905 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MT-ND4P03905 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MT-ND4P03905 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MT-ND4P03905 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MT-ND4P03905 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MT-ND4P03905 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MT-ND4P03905 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MT-ND4P03905 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MT-ND4P03905 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MT-ND4P03905 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MT-ND4P03905 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MT-ND4P03905 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MT-ND4P03905 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MT-ND4P03905 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MT-ND4P03905 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MT-ND4P03905 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MT-ND4P03905 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MT-ND4P03905 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MT-ND4P03905 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MT-ND4P03905 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-ND4P03905 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND4P03905 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND4P03905 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND4P03905 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND4P03905 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND4P03905 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND4P03905 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND4P03905 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND4P03905 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND4P03905 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-ND4P03905 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MT-ND4P03905 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND4P03905 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND4P03905 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND4P03905 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND4P03905 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND4P03905 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND4P03905 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MT-ND4P03905 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND4P03905 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MT-ND4P03905 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MT-ND4P03905 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MT-ND4P03905 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MT-ND4P03905 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MT-ND4P03905 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MT-ND4P03905 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MT-ND4P03905 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MT-ND4P03905 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MT-ND4P03905 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MT-ND4P03905 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MT-ND4P03905 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MT-ND4P03905 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MT-ND4P03905 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms