Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA21P01568 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA21P01568 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNA21P01568 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNA21P01568 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNA21P01568 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNA21P01568 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA21P01568 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA21P01568 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA21P01568 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA21P01568 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNA21P01568 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA21P01568 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA21P01568 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA21P01568 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA21P01568 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA21P01568 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA21P01568 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA21P01568 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA21P01568 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA21P01568 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA21P01568 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNA21P01568 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNA21P01568 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNA21P01568 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA21P01568 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA21P01568 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNA21P01568 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNA21P01568 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNA21P01568 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNA21P01568 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNA21P01568 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA21P01568 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA21P01568 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA21P01568 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA21P01568 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA21P01568 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNA21P01568 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNA21P01568 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNA21P01568 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA21P01568 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA21P01568 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA21P01568 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNA21P01568 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNA21P01568 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNA21P01568 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNA21P01568 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNA21P01568 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNA21P01568 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA21P01568 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA21P01568 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA21P01568 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNA21P01568 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNA21P01568 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNA21P01568 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNA21P01568 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNA21P01568 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNA21P01568 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNA21P01568 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNA21P01568 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNA21P01568 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA21P01568 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA21P01568 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA21P01568 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNA21P01568 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNA21P01568 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA21P01568 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA21P01568 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA21P01568 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNA21P01568 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA21P01568 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA21P01568 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA21P01568 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA21P01568 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA21P01568 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA21P01568 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNA21P01568 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNA21P01568 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA21P01568 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNA21P01568 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNA21P01568 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNA21P01568 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNA21P01568 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA21P01568 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA21P01568 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA21P01568 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA21P01568 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA21P01568 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA21P01568 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA21P01568 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA21P01568 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA21P01568 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA21P01568 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA21P01568 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA21P01568 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA21P01568 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNA21P01568 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNA21P01568 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA21P01568 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms