Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STAMBPO95630 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STAMBPO95630 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STAMBPO95630 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STAMBPO95630 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STAMBPO95630 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STAMBPO95630 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STAMBPO95630 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STAMBPO95630 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STAMBPO95630 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STAMBPO95630 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STAMBPO95630 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STAMBPO95630 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STAMBPO95630 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STAMBPO95630 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STAMBPO95630 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STAMBPO95630 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STAMBPO95630 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STAMBPO95630 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26■■□□□ 1.75
STAMBPO95630 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STAMBPO95630 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STAMBPO95630 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STAMBPO95630 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STAMBPO95630 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STAMBPO95630 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STAMBPO95630 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STAMBPO95630 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
STAMBPO95630 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
STAMBPO95630 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
STAMBPO95630 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STAMBPO95630 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STAMBPO95630 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STAMBPO95630 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STAMBPO95630 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STAMBPO95630 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STAMBPO95630 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STAMBPO95630 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STAMBPO95630 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STAMBPO95630 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STAMBPO95630 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STAMBPO95630 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STAMBPO95630 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STAMBPO95630 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STAMBPO95630 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STAMBPO95630 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STAMBPO95630 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STAMBPO95630 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STAMBPO95630 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STAMBPO95630 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STAMBPO95630 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
STAMBPO95630 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STAMBPO95630 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STAMBPO95630 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STAMBPO95630 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STAMBPO95630 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STAMBPO95630 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STAMBPO95630 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STAMBPO95630 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STAMBPO95630 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STAMBPO95630 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STAMBPO95630 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STAMBPO95630 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
STAMBPO95630 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STAMBPO95630 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STAMBPO95630 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STAMBPO95630 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
STAMBPO95630 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STAMBPO95630 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STAMBPO95630 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STAMBPO95630 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STAMBPO95630 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STAMBPO95630 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STAMBPO95630 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STAMBPO95630 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STAMBPO95630 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STAMBPO95630 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STAMBPO95630 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STAMBPO95630 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
STAMBPO95630 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STAMBPO95630 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STAMBPO95630 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STAMBPO95630 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STAMBPO95630 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STAMBPO95630 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STAMBPO95630 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
STAMBPO95630 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STAMBPO95630 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STAMBPO95630 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STAMBPO95630 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STAMBPO95630 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STAMBPO95630 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STAMBPO95630 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STAMBPO95630 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STAMBPO95630 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STAMBPO95630 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STAMBPO95630 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STAMBPO95630 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
STAMBPO95630 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
STAMBPO95630 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STAMBPO95630 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms