Protein–RNA interactions for Protein: O95456

PSMG1, Proteasome assembly chaperone 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMG1O95456 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMG1O95456 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMG1O95456 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMG1O95456 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMG1O95456 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMG1O95456 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMG1O95456 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMG1O95456 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMG1O95456 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMG1O95456 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMG1O95456 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMG1O95456 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMG1O95456 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMG1O95456 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMG1O95456 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMG1O95456 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMG1O95456 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMG1O95456 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMG1O95456 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMG1O95456 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMG1O95456 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMG1O95456 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMG1O95456 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMG1O95456 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMG1O95456 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMG1O95456 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMG1O95456 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMG1O95456 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMG1O95456 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMG1O95456 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMG1O95456 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMG1O95456 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMG1O95456 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMG1O95456 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMG1O95456 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMG1O95456 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMG1O95456 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMG1O95456 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMG1O95456 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSMG1O95456 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMG1O95456 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMG1O95456 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMG1O95456 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMG1O95456 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMG1O95456 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMG1O95456 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMG1O95456 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMG1O95456 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMG1O95456 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMG1O95456 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMG1O95456 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMG1O95456 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMG1O95456 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMG1O95456 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMG1O95456 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMG1O95456 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMG1O95456 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMG1O95456 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSMG1O95456 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSMG1O95456 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSMG1O95456 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMG1O95456 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMG1O95456 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMG1O95456 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMG1O95456 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMG1O95456 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMG1O95456 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMG1O95456 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMG1O95456 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMG1O95456 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMG1O95456 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMG1O95456 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMG1O95456 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMG1O95456 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMG1O95456 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMG1O95456 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMG1O95456 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMG1O95456 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMG1O95456 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMG1O95456 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMG1O95456 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMG1O95456 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMG1O95456 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMG1O95456 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMG1O95456 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMG1O95456 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMG1O95456 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMG1O95456 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMG1O95456 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMG1O95456 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMG1O95456 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMG1O95456 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMG1O95456 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMG1O95456 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMG1O95456 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMG1O95456 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMG1O95456 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMG1O95456 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMG1O95456 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMG1O95456 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms