Protein–RNA interactions for Protein: O95238

SPDEF, SAM pointed domain-containing Ets transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDEFO95238 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDEFO95238 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDEFO95238 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDEFO95238 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDEFO95238 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDEFO95238 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPDEFO95238 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPDEFO95238 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPDEFO95238 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPDEFO95238 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPDEFO95238 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPDEFO95238 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPDEFO95238 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPDEFO95238 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPDEFO95238 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPDEFO95238 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPDEFO95238 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPDEFO95238 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPDEFO95238 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPDEFO95238 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPDEFO95238 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPDEFO95238 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPDEFO95238 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPDEFO95238 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPDEFO95238 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPDEFO95238 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPDEFO95238 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPDEFO95238 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPDEFO95238 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPDEFO95238 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPDEFO95238 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPDEFO95238 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPDEFO95238 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPDEFO95238 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPDEFO95238 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPDEFO95238 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPDEFO95238 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPDEFO95238 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPDEFO95238 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPDEFO95238 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPDEFO95238 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPDEFO95238 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPDEFO95238 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPDEFO95238 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPDEFO95238 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPDEFO95238 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPDEFO95238 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPDEFO95238 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPDEFO95238 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPDEFO95238 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPDEFO95238 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPDEFO95238 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPDEFO95238 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPDEFO95238 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPDEFO95238 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDEFO95238 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDEFO95238 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDEFO95238 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDEFO95238 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDEFO95238 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDEFO95238 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDEFO95238 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDEFO95238 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDEFO95238 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDEFO95238 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDEFO95238 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDEFO95238 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDEFO95238 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDEFO95238 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDEFO95238 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDEFO95238 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDEFO95238 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDEFO95238 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPDEFO95238 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPDEFO95238 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPDEFO95238 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPDEFO95238 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDEFO95238 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms