Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
LRP5O75197 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
LRP5O75197 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
LRP5O75197 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
LRP5O75197 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
LRP5O75197 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
LRP5O75197 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
LRP5O75197 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
LRP5O75197 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
LRP5O75197 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
LRP5O75197 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
LRP5O75197 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
LRP5O75197 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
LRP5O75197 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
LRP5O75197 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
LRP5O75197 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
LRP5O75197 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
LRP5O75197 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
LRP5O75197 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
LRP5O75197 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
LRP5O75197 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
LRP5O75197 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
LRP5O75197 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
LRP5O75197 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
LRP5O75197 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LRP5O75197 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
LRP5O75197 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
LRP5O75197 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LRP5O75197 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LRP5O75197 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
LRP5O75197 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
LRP5O75197 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
LRP5O75197 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
LRP5O75197 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
LRP5O75197 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
LRP5O75197 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
LRP5O75197 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
LRP5O75197 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
LRP5O75197 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
LRP5O75197 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRP5O75197 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRP5O75197 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
LRP5O75197 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
LRP5O75197 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
LRP5O75197 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
LRP5O75197 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
LRP5O75197 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRP5O75197 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRP5O75197 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRP5O75197 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRP5O75197 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRP5O75197 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRP5O75197 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRP5O75197 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
LRP5O75197 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRP5O75197 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRP5O75197 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRP5O75197 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRP5O75197 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRP5O75197 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
LRP5O75197 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRP5O75197 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRP5O75197 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRP5O75197 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRP5O75197 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRP5O75197 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
LRP5O75197 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
LRP5O75197 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
LRP5O75197 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRP5O75197 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRP5O75197 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRP5O75197 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LRP5O75197 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LRP5O75197 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
LRP5O75197 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
LRP5O75197 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
LRP5O75197 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LRP5O75197 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LRP5O75197 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
LRP5O75197 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
LRP5O75197 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
LRP5O75197 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRP5O75197 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRP5O75197 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRP5O75197 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRP5O75197 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LRP5O75197 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LRP5O75197 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
LRP5O75197 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
LRP5O75197 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
LRP5O75197 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRP5O75197 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRP5O75197 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRP5O75197 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LRP5O75197 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRP5O75197 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRP5O75197 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRP5O75197 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRP5O75197 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
LRP5O75197 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms