Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC56.68■■■■■ 6.66
ABCC9O60706 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.65■■■■■ 6.66
ABCC9O60706 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.62■■■■■ 6.65
ABCC9O60706 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.61■■■■■ 6.65
ABCC9O60706 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC56.6■■■■■ 6.65
ABCC9O60706 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC56.6■■■■■ 6.65
ABCC9O60706 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC56.59■■■■■ 6.65
ABCC9O60706 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC56.58■■■■■ 6.65
ABCC9O60706 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.57■■■■■ 6.65
ABCC9O60706 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.55■■■■■ 6.64
ABCC9O60706 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC56.54■■■■■ 6.64
ABCC9O60706 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC56.52■■■■■ 6.64
ABCC9O60706 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC56.51■■■■■ 6.64
ABCC9O60706 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC56.51■■■■■ 6.64
ABCC9O60706 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.48■■■■■ 6.63
ABCC9O60706 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC56.48■■■■■ 6.63
ABCC9O60706 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC56.48■■■■■ 6.63
ABCC9O60706 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC56.43■■■■■ 6.62
ABCC9O60706 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC56.41■■■■■ 6.62
ABCC9O60706 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC56.41■■■■■ 6.62
ABCC9O60706 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.4■■■■■ 6.62
ABCC9O60706 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC56.39■■■■■ 6.62
ABCC9O60706 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC56.38■■■■■ 6.62
ABCC9O60706 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC56.37■■■■■ 6.61
ABCC9O60706 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC56.33■■■■■ 6.61
ABCC9O60706 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC56.31■■■■■ 6.6
ABCC9O60706 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC56.31■■■■■ 6.6
ABCC9O60706 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC56.28■■■■■ 6.6
ABCC9O60706 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC56.28■■■■■ 6.6
ABCC9O60706 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.27■■■■■ 6.6
ABCC9O60706 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC56.27■■■■■ 6.6
ABCC9O60706 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC56.27■■■■■ 6.6
ABCC9O60706 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC56.26■■■■■ 6.6
ABCC9O60706 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC56.23■■■■■ 6.59
ABCC9O60706 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC56.23■■■■■ 6.59
ABCC9O60706 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.23■■■■■ 6.59
ABCC9O60706 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.17■■■■■ 6.58
ABCC9O60706 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC56.15■■■■■ 6.58
ABCC9O60706 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC56.14■■■■■ 6.58
ABCC9O60706 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC56.14■■■■■ 6.58
ABCC9O60706 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC56.12■■■■■ 6.57
ABCC9O60706 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC56.12■■■■■ 6.57
ABCC9O60706 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.08■■■■■ 6.57
ABCC9O60706 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC56.05■■■■■ 6.56
ABCC9O60706 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC56.05■■■■■ 6.56
ABCC9O60706 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC56.03■■■■■ 6.56
ABCC9O60706 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC55.98■■■■■ 6.55
ABCC9O60706 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.98■■■■■ 6.55
ABCC9O60706 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC55.98■■■■■ 6.55
ABCC9O60706 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC55.98■■■■■ 6.55
ABCC9O60706 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.97■■■■■ 6.55
ABCC9O60706 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC55.97■■■■■ 6.55
ABCC9O60706 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.95■■■■■ 6.55
ABCC9O60706 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC55.94■■■■■ 6.55
ABCC9O60706 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.94■■■■■ 6.55
ABCC9O60706 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.94■■■■■ 6.55
ABCC9O60706 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC55.93■■■■■ 6.54
ABCC9O60706 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC55.92■■■■■ 6.54
ABCC9O60706 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC55.92■■■■■ 6.54
ABCC9O60706 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC55.92■■■■■ 6.54
ABCC9O60706 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC55.92■■■■■ 6.54
ABCC9O60706 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC55.88■■■■■ 6.54
ABCC9O60706 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.87■■■■■ 6.53
ABCC9O60706 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC55.87■■■■■ 6.53
ABCC9O60706 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC55.84■■■■■ 6.53
ABCC9O60706 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.83■■■■■ 6.53
ABCC9O60706 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC55.82■■■■■ 6.53
ABCC9O60706 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.82■■■■■ 6.53
ABCC9O60706 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC55.82■■■■■ 6.53
ABCC9O60706 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC55.81■■■■■ 6.52
ABCC9O60706 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC55.81■■■■■ 6.52
ABCC9O60706 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.8■■■■■ 6.52
ABCC9O60706 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC55.79■■■■■ 6.52
ABCC9O60706 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.76■■■■■ 6.52
ABCC9O60706 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC55.76■■■■■ 6.52
ABCC9O60706 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC55.76■■■■■ 6.52
ABCC9O60706 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC55.75■■■■■ 6.52
ABCC9O60706 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.73■■■■■ 6.51
ABCC9O60706 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.72■■■■■ 6.51
ABCC9O60706 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.68■■■■■ 6.5
ABCC9O60706 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC55.68■■■■■ 6.5
ABCC9O60706 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.67■■■■■ 6.5
ABCC9O60706 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.67■■■■■ 6.5
ABCC9O60706 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC55.65■■■■■ 6.5
ABCC9O60706 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC55.65■■■■■ 6.5
ABCC9O60706 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.65■■■■■ 6.5
ABCC9O60706 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC55.64■■■■■ 6.5
ABCC9O60706 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.63■■■■■ 6.5
ABCC9O60706 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC55.62■■■■■ 6.49
ABCC9O60706 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC55.62■■■■■ 6.49
ABCC9O60706 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.58■■■■■ 6.49
ABCC9O60706 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC55.58■■■■■ 6.49
ABCC9O60706 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC55.56■■■■■ 6.49
ABCC9O60706 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC55.56■■■■■ 6.49
ABCC9O60706 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC55.55■■■■■ 6.48
ABCC9O60706 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC55.54■■■■■ 6.48
ABCC9O60706 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC55.52■■■■■ 6.48
ABCC9O60706 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.52■■■■■ 6.48
ABCC9O60706 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.52■■■■■ 6.48
ABCC9O60706 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.51■■■■■ 6.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms