Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC25A20O43772 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A20O43772 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A20O43772 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A20O43772 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A20O43772 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A20O43772 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC25A20O43772 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A20O43772 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC25A20O43772 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A20O43772 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A20O43772 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A20O43772 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC25A20O43772 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A20O43772 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A20O43772 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC25A20O43772 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A20O43772 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A20O43772 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A20O43772 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A20O43772 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A20O43772 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A20O43772 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A20O43772 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A20O43772 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A20O43772 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A20O43772 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A20O43772 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC25A20O43772 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC25A20O43772 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC25A20O43772 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC25A20O43772 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC25A20O43772 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC25A20O43772 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC25A20O43772 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC25A20O43772 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC25A20O43772 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC25A20O43772 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC25A20O43772 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC25A20O43772 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC25A20O43772 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A20O43772 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A20O43772 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A20O43772 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A20O43772 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A20O43772 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A20O43772 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A20O43772 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A20O43772 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A20O43772 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A20O43772 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A20O43772 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A20O43772 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A20O43772 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A20O43772 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A20O43772 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A20O43772 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A20O43772 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A20O43772 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A20O43772 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A20O43772 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A20O43772 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A20O43772 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A20O43772 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A20O43772 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A20O43772 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms