Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GSC2O15499 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GSC2O15499 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSC2O15499 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSC2O15499 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSC2O15499 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSC2O15499 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GSC2O15499 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GSC2O15499 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GSC2O15499 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GSC2O15499 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GSC2O15499 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GSC2O15499 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSC2O15499 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSC2O15499 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSC2O15499 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSC2O15499 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSC2O15499 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSC2O15499 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSC2O15499 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSC2O15499 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSC2O15499 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSC2O15499 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSC2O15499 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSC2O15499 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSC2O15499 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSC2O15499 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSC2O15499 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSC2O15499 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSC2O15499 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSC2O15499 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSC2O15499 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSC2O15499 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSC2O15499 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GSC2O15499 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSC2O15499 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GSC2O15499 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GSC2O15499 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GSC2O15499 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSC2O15499 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSC2O15499 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSC2O15499 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSC2O15499 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSC2O15499 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSC2O15499 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSC2O15499 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSC2O15499 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSC2O15499 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSC2O15499 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSC2O15499 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSC2O15499 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSC2O15499 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSC2O15499 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSC2O15499 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSC2O15499 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GSC2O15499 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSC2O15499 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSC2O15499 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSC2O15499 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSC2O15499 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSC2O15499 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GSC2O15499 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSC2O15499 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSC2O15499 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSC2O15499 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSC2O15499 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GSC2O15499 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GSC2O15499 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GSC2O15499 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GSC2O15499 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GSC2O15499 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSC2O15499 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSC2O15499 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GSC2O15499 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSC2O15499 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GSC2O15499 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSC2O15499 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSC2O15499 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSC2O15499 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GSC2O15499 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSC2O15499 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSC2O15499 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSC2O15499 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSC2O15499 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSC2O15499 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSC2O15499 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GSC2O15499 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GSC2O15499 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GSC2O15499 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSC2O15499 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GSC2O15499 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GSC2O15499 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GSC2O15499 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GSC2O15499 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GSC2O15499 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GSC2O15499 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GSC2O15499 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSC2O15499 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSC2O15499 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSC2O15499 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms