Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSO14618 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSO14618 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSO14618 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSO14618 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSO14618 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSO14618 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSO14618 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSO14618 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSO14618 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSO14618 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSO14618 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSO14618 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSO14618 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSO14618 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSO14618 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSO14618 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSO14618 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSO14618 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSO14618 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSO14618 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSO14618 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSO14618 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCSO14618 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSO14618 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSO14618 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSO14618 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSO14618 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSO14618 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSO14618 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSO14618 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSO14618 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSO14618 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSO14618 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSO14618 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSO14618 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSO14618 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCSO14618 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSO14618 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCSO14618 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCSO14618 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSO14618 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSO14618 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSO14618 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSO14618 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSO14618 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSO14618 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSO14618 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSO14618 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSO14618 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSO14618 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSO14618 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSO14618 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSO14618 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSO14618 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCSO14618 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCSO14618 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSO14618 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSO14618 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSO14618 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSO14618 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSO14618 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSO14618 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSO14618 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSO14618 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSO14618 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSO14618 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSO14618 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSO14618 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSO14618 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSO14618 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSO14618 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSO14618 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSO14618 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSO14618 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSO14618 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSO14618 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSO14618 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSO14618 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSO14618 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSO14618 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSO14618 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSO14618 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSO14618 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSO14618 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSO14618 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSO14618 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSO14618 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSO14618 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSO14618 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSO14618 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSO14618 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSO14618 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSO14618 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSO14618 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSO14618 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSO14618 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSO14618 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSO14618 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCSO14618 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms