Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EBAG9O00559 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EBAG9O00559 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
EBAG9O00559 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EBAG9O00559 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
EBAG9O00559 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EBAG9O00559 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EBAG9O00559 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EBAG9O00559 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EBAG9O00559 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EBAG9O00559 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EBAG9O00559 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EBAG9O00559 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EBAG9O00559 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EBAG9O00559 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EBAG9O00559 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EBAG9O00559 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EBAG9O00559 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EBAG9O00559 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EBAG9O00559 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EBAG9O00559 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EBAG9O00559 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EBAG9O00559 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EBAG9O00559 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EBAG9O00559 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EBAG9O00559 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EBAG9O00559 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EBAG9O00559 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EBAG9O00559 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EBAG9O00559 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EBAG9O00559 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EBAG9O00559 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EBAG9O00559 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EBAG9O00559 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EBAG9O00559 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EBAG9O00559 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EBAG9O00559 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EBAG9O00559 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
EBAG9O00559 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EBAG9O00559 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EBAG9O00559 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EBAG9O00559 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EBAG9O00559 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EBAG9O00559 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EBAG9O00559 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EBAG9O00559 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EBAG9O00559 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EBAG9O00559 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EBAG9O00559 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EBAG9O00559 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EBAG9O00559 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EBAG9O00559 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EBAG9O00559 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EBAG9O00559 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EBAG9O00559 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EBAG9O00559 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
EBAG9O00559 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EBAG9O00559 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EBAG9O00559 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EBAG9O00559 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EBAG9O00559 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EBAG9O00559 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EBAG9O00559 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EBAG9O00559 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EBAG9O00559 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EBAG9O00559 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EBAG9O00559 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EBAG9O00559 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EBAG9O00559 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EBAG9O00559 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EBAG9O00559 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EBAG9O00559 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EBAG9O00559 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EBAG9O00559 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EBAG9O00559 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EBAG9O00559 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EBAG9O00559 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EBAG9O00559 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EBAG9O00559 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EBAG9O00559 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EBAG9O00559 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EBAG9O00559 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EBAG9O00559 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
EBAG9O00559 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EBAG9O00559 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EBAG9O00559 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EBAG9O00559 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
EBAG9O00559 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EBAG9O00559 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EBAG9O00559 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EBAG9O00559 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EBAG9O00559 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EBAG9O00559 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBAG9O00559 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBAG9O00559 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBAG9O00559 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBAG9O00559 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBAG9O00559 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBAG9O00559 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EBAG9O00559 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms