Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms