Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF1

SAC3D1, SAC3 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAC3D1A6NKF1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAC3D1A6NKF1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAC3D1A6NKF1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAC3D1A6NKF1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAC3D1A6NKF1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAC3D1A6NKF1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAC3D1A6NKF1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAC3D1A6NKF1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SAC3D1A6NKF1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAC3D1A6NKF1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAC3D1A6NKF1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAC3D1A6NKF1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SAC3D1A6NKF1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAC3D1A6NKF1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAC3D1A6NKF1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAC3D1A6NKF1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAC3D1A6NKF1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAC3D1A6NKF1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAC3D1A6NKF1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAC3D1A6NKF1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAC3D1A6NKF1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAC3D1A6NKF1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAC3D1A6NKF1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAC3D1A6NKF1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAC3D1A6NKF1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAC3D1A6NKF1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAC3D1A6NKF1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SAC3D1A6NKF1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAC3D1A6NKF1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAC3D1A6NKF1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAC3D1A6NKF1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAC3D1A6NKF1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAC3D1A6NKF1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAC3D1A6NKF1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAC3D1A6NKF1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SAC3D1A6NKF1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAC3D1A6NKF1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAC3D1A6NKF1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAC3D1A6NKF1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAC3D1A6NKF1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAC3D1A6NKF1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAC3D1A6NKF1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAC3D1A6NKF1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAC3D1A6NKF1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAC3D1A6NKF1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAC3D1A6NKF1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAC3D1A6NKF1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAC3D1A6NKF1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAC3D1A6NKF1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAC3D1A6NKF1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAC3D1A6NKF1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAC3D1A6NKF1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAC3D1A6NKF1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAC3D1A6NKF1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAC3D1A6NKF1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAC3D1A6NKF1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAC3D1A6NKF1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SAC3D1A6NKF1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAC3D1A6NKF1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SAC3D1A6NKF1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAC3D1A6NKF1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAC3D1A6NKF1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAC3D1A6NKF1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAC3D1A6NKF1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAC3D1A6NKF1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAC3D1A6NKF1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAC3D1A6NKF1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAC3D1A6NKF1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAC3D1A6NKF1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAC3D1A6NKF1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAC3D1A6NKF1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAC3D1A6NKF1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAC3D1A6NKF1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAC3D1A6NKF1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAC3D1A6NKF1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAC3D1A6NKF1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAC3D1A6NKF1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAC3D1A6NKF1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAC3D1A6NKF1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAC3D1A6NKF1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAC3D1A6NKF1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAC3D1A6NKF1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAC3D1A6NKF1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAC3D1A6NKF1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAC3D1A6NKF1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAC3D1A6NKF1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAC3D1A6NKF1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAC3D1A6NKF1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAC3D1A6NKF1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAC3D1A6NKF1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAC3D1A6NKF1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAC3D1A6NKF1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAC3D1A6NKF1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAC3D1A6NKF1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAC3D1A6NKF1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SAC3D1A6NKF1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAC3D1A6NKF1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAC3D1A6NKF1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAC3D1A6NKF1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAC3D1A6NKF1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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