Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC160A6NGH7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC160A6NGH7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC160A6NGH7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC160A6NGH7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC160A6NGH7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC160A6NGH7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC160A6NGH7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC160A6NGH7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC160A6NGH7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC160A6NGH7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC160A6NGH7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC160A6NGH7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC160A6NGH7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC160A6NGH7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC160A6NGH7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC160A6NGH7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC160A6NGH7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC160A6NGH7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC160A6NGH7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC160A6NGH7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC160A6NGH7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC160A6NGH7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC160A6NGH7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC160A6NGH7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC160A6NGH7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC160A6NGH7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC160A6NGH7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC160A6NGH7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC160A6NGH7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC160A6NGH7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC160A6NGH7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC160A6NGH7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC160A6NGH7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC160A6NGH7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC160A6NGH7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC160A6NGH7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC160A6NGH7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC160A6NGH7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC160A6NGH7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC160A6NGH7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC160A6NGH7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC160A6NGH7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC160A6NGH7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC160A6NGH7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC160A6NGH7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC160A6NGH7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC160A6NGH7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC160A6NGH7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC160A6NGH7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC160A6NGH7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC160A6NGH7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC160A6NGH7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC160A6NGH7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC160A6NGH7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC160A6NGH7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC160A6NGH7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC160A6NGH7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC160A6NGH7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC160A6NGH7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC160A6NGH7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC160A6NGH7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC160A6NGH7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC160A6NGH7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC160A6NGH7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC160A6NGH7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC160A6NGH7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC160A6NGH7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC160A6NGH7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC160A6NGH7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC160A6NGH7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC160A6NGH7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC160A6NGH7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC160A6NGH7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC160A6NGH7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC160A6NGH7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC160A6NGH7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC160A6NGH7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC160A6NGH7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC160A6NGH7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC160A6NGH7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms