Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3P1A6NDR6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3P1A6NDR6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3P1A6NDR6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3P1A6NDR6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P1A6NDR6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P1A6NDR6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3P1A6NDR6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3P1A6NDR6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3P1A6NDR6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3P1A6NDR6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3P1A6NDR6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3P1A6NDR6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3P1A6NDR6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3P1A6NDR6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3P1A6NDR6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3P1A6NDR6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3P1A6NDR6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3P1A6NDR6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3P1A6NDR6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3P1A6NDR6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3P1A6NDR6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3P1A6NDR6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3P1A6NDR6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3P1A6NDR6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P1A6NDR6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P1A6NDR6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3P1A6NDR6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3P1A6NDR6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3P1A6NDR6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3P1A6NDR6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3P1A6NDR6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3P1A6NDR6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3P1A6NDR6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEIS3P1A6NDR6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3P1A6NDR6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3P1A6NDR6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3P1A6NDR6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P1A6NDR6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3P1A6NDR6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3P1A6NDR6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3P1A6NDR6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3P1A6NDR6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3P1A6NDR6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEIS3P1A6NDR6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3P1A6NDR6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3P1A6NDR6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3P1A6NDR6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3P1A6NDR6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3P1A6NDR6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3P1A6NDR6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3P1A6NDR6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3P1A6NDR6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3P1A6NDR6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3P1A6NDR6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3P1A6NDR6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3P1A6NDR6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3P1A6NDR6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3P1A6NDR6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P1A6NDR6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P1A6NDR6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P1A6NDR6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P1A6NDR6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P1A6NDR6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P1A6NDR6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3P1A6NDR6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3P1A6NDR6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3P1A6NDR6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3P1A6NDR6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3P1A6NDR6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3P1A6NDR6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEIS3P1A6NDR6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3P1A6NDR6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3P1A6NDR6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3P1A6NDR6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3P1A6NDR6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3P1A6NDR6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEIS3P1A6NDR6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEIS3P1A6NDR6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEIS3P1A6NDR6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3P1A6NDR6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3P1A6NDR6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEIS3P1A6NDR6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3P1A6NDR6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3P1A6NDR6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEIS3P1A6NDR6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MEIS3P1A6NDR6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3P1A6NDR6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3P1A6NDR6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3P1A6NDR6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3P1A6NDR6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3P1A6NDR6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P1A6NDR6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P1A6NDR6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P1A6NDR6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P1A6NDR6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P1A6NDR6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P1A6NDR6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P1A6NDR6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3P1A6NDR6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms