Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
PSDA5PKW4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
PSDA5PKW4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PSDA5PKW4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PSDA5PKW4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PSDA5PKW4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PSDA5PKW4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PSDA5PKW4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PSDA5PKW4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PSDA5PKW4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PSDA5PKW4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PSDA5PKW4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PSDA5PKW4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PSDA5PKW4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PSDA5PKW4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PSDA5PKW4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PSDA5PKW4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
PSDA5PKW4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PSDA5PKW4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PSDA5PKW4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PSDA5PKW4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PSDA5PKW4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PSDA5PKW4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PSDA5PKW4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PSDA5PKW4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PSDA5PKW4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PSDA5PKW4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PSDA5PKW4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PSDA5PKW4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PSDA5PKW4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PSDA5PKW4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PSDA5PKW4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PSDA5PKW4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PSDA5PKW4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
PSDA5PKW4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PSDA5PKW4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PSDA5PKW4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PSDA5PKW4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PSDA5PKW4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PSDA5PKW4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PSDA5PKW4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PSDA5PKW4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PSDA5PKW4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PSDA5PKW4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PSDA5PKW4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PSDA5PKW4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PSDA5PKW4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PSDA5PKW4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PSDA5PKW4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PSDA5PKW4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PSDA5PKW4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PSDA5PKW4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PSDA5PKW4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PSDA5PKW4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PSDA5PKW4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PSDA5PKW4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PSDA5PKW4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PSDA5PKW4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
PSDA5PKW4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
PSDA5PKW4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
PSDA5PKW4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PSDA5PKW4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PSDA5PKW4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PSDA5PKW4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PSDA5PKW4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PSDA5PKW4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PSDA5PKW4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
PSDA5PKW4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
PSDA5PKW4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PSDA5PKW4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PSDA5PKW4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PSDA5PKW4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PSDA5PKW4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PSDA5PKW4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PSDA5PKW4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PSDA5PKW4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PSDA5PKW4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PSDA5PKW4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
PSDA5PKW4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PSDA5PKW4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PSDA5PKW4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PSDA5PKW4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PSDA5PKW4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PSDA5PKW4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PSDA5PKW4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PSDA5PKW4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PSDA5PKW4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PSDA5PKW4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PSDA5PKW4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PSDA5PKW4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PSDA5PKW4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PSDA5PKW4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PSDA5PKW4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PSDA5PKW4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PSDA5PKW4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PSDA5PKW4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PSDA5PKW4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PSDA5PKW4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PSDA5PKW4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PSDA5PKW4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms