Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTAGE9A4FU28 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTAGE9A4FU28 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CTAGE9A4FU28 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTAGE9A4FU28 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTAGE9A4FU28 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTAGE9A4FU28 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTAGE9A4FU28 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTAGE9A4FU28 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTAGE9A4FU28 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTAGE9A4FU28 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTAGE9A4FU28 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTAGE9A4FU28 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTAGE9A4FU28 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTAGE9A4FU28 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTAGE9A4FU28 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTAGE9A4FU28 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTAGE9A4FU28 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTAGE9A4FU28 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CTAGE9A4FU28 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTAGE9A4FU28 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTAGE9A4FU28 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTAGE9A4FU28 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTAGE9A4FU28 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTAGE9A4FU28 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTAGE9A4FU28 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTAGE9A4FU28 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTAGE9A4FU28 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTAGE9A4FU28 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTAGE9A4FU28 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTAGE9A4FU28 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTAGE9A4FU28 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTAGE9A4FU28 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTAGE9A4FU28 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTAGE9A4FU28 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTAGE9A4FU28 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTAGE9A4FU28 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CTAGE9A4FU28 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTAGE9A4FU28 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTAGE9A4FU28 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTAGE9A4FU28 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTAGE9A4FU28 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTAGE9A4FU28 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTAGE9A4FU28 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTAGE9A4FU28 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTAGE9A4FU28 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTAGE9A4FU28 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTAGE9A4FU28 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTAGE9A4FU28 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTAGE9A4FU28 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTAGE9A4FU28 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTAGE9A4FU28 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTAGE9A4FU28 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTAGE9A4FU28 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTAGE9A4FU28 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTAGE9A4FU28 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTAGE9A4FU28 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTAGE9A4FU28 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CTAGE9A4FU28 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTAGE9A4FU28 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTAGE9A4FU28 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTAGE9A4FU28 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTAGE9A4FU28 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTAGE9A4FU28 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTAGE9A4FU28 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTAGE9A4FU28 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTAGE9A4FU28 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTAGE9A4FU28 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTAGE9A4FU28 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTAGE9A4FU28 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTAGE9A4FU28 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTAGE9A4FU28 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTAGE9A4FU28 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTAGE9A4FU28 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTAGE9A4FU28 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTAGE9A4FU28 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTAGE9A4FU28 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTAGE9A4FU28 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTAGE9A4FU28 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTAGE9A4FU28 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTAGE9A4FU28 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTAGE9A4FU28 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTAGE9A4FU28 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTAGE9A4FU28 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTAGE9A4FU28 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTAGE9A4FU28 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTAGE9A4FU28 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTAGE9A4FU28 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTAGE9A4FU28 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTAGE9A4FU28 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTAGE9A4FU28 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTAGE9A4FU28 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTAGE9A4FU28 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CTAGE9A4FU28 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTAGE9A4FU28 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTAGE9A4FU28 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTAGE9A4FU28 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTAGE9A4FU28 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTAGE9A4FU28 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTAGE9A4FU28 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms