Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQ09

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQ09 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ09 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ09 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ09 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ09 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ09 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A1W2PQ09 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ09 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ09 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ09 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ09 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ09 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ09 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ09 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ09 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A1W2PQ09 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
A0A1W2PQ09 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A1W2PQ09 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A1W2PQ09 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A1W2PQ09 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A1W2PQ09 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A1W2PQ09 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A1W2PQ09 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A1W2PQ09 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A1W2PQ09 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A1W2PQ09 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A1W2PQ09 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A1W2PQ09 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A1W2PQ09 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A1W2PQ09 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A1W2PQ09 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A1W2PQ09 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A1W2PQ09 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A1W2PQ09 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A1W2PQ09 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A1W2PQ09 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A1W2PQ09 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A1W2PQ09 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A1W2PQ09 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A1W2PQ09 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A1W2PQ09 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A1W2PQ09 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A1W2PQ09 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A1W2PQ09 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A1W2PQ09 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A1W2PQ09 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A1W2PQ09 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A1W2PQ09 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A1W2PQ09 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A1W2PQ09 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A1W2PQ09 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1W2PQ09 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1W2PQ09 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1W2PQ09 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A1W2PQ09 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A1W2PQ09 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A1W2PQ09 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1W2PQ09 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1W2PQ09 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1W2PQ09 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1W2PQ09 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1W2PQ09 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1W2PQ09 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A1W2PQ09 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A1W2PQ09 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A1W2PQ09 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A1W2PQ09 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A1W2PQ09 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A1W2PQ09 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PQ09 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PQ09 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PQ09 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PQ09 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PQ09 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PQ09 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PQ09 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PQ09 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQ09 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQ09 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PQ09 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PQ09 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PQ09 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A1W2PQ09 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQ09 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQ09 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQ09 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQ09 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQ09 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PQ09 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PQ09 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PQ09 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PQ09 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1W2PQ09 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1W2PQ09 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1W2PQ09 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1W2PQ09 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms