Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J293

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J293 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0B4J293 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0B4J293 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0B4J293 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0B4J293 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0B4J293 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0B4J293 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0B4J293 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0B4J293 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J293 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0B4J293 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J293 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J293 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J293 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0B4J293 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0B4J293 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0B4J293 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0B4J293 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0B4J293 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0B4J293 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0B4J293 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0B4J293 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0B4J293 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0B4J293 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0B4J293 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0B4J293 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0B4J293 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0B4J293 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0B4J293 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0B4J293 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0B4J293 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0B4J293 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0B4J293 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0B4J293 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0B4J293 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0B4J293 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0B4J293 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0B4J293 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0B4J293 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0B4J293 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0B4J293 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0B4J293 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0B4J293 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0B4J293 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0B4J293 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0B4J293 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0B4J293 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0B4J293 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0B4J293 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0B4J293 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0B4J293 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0B4J293 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0B4J293 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0B4J293 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0B4J293 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0B4J293 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0B4J293 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0B4J293 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0B4J293 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0B4J293 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0B4J293 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0B4J293 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0B4J293 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0B4J293 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0B4J293 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0B4J293 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0B4J293 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0B4J293 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0B4J293 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0B4J293 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0B4J293 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0B4J293 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0B4J293 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0B4J293 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0B4J293 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0B4J293 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0B4J293 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms