Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 NAA50-210ENST00000616174 3257 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 GK-207ENST00000427190 4573 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SPATS2L-206ENST00000409385 2320 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 TIAM1-206ENST00000541036 7018 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 C16orf62-201ENST00000251143 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ATF3-206ENST00000366987 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PCDHGA10-202ENST00000612503 4462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PEX5L-205ENST00000464614 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LCN2-202ENST00000372998 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LINC02105-201ENST00000504552 1003 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC023162.1-201ENST00000505608 474 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AP000911.1-205ENST00000527712 594 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CIRBP-AS1-201ENST00000585832 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SLC3A1-201ENST00000260649 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 NAGA-202ENST00000402937 1869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SPATA13-202ENST00000382095 6665 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RRP7A-201ENST00000323013 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LAMB1-204ENST00000393561 5766 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PCDHGA4-201ENST00000571252 4778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 NUPR1-201ENST00000324873 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 XRRA1-201ENST00000321448 4695 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC092819.1-201ENST00000519981 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AL450306.1-201ENST00000434097 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SETD7-201ENST00000274031 7365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CSPG4P10-201ENST00000456932 4817 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 MCOLN3-202ENST00000370587 2953 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LIMCH1-208ENST00000508501 5054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LIMCH1-217ENST00000512946 5057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 TCF4-209ENST00000544241 2264 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 TTI2-206ENST00000613904 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 FAM83A-208ENST00000536633 3701 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC079594.2-201ENST00000483754 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CLCN5-203ENST00000376091 3046 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ABLIM1-201ENST00000277895 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 COPS7A-203ENST00000534877 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PGM2-201ENST00000381967 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 HPS4-202ENST00000398145 4497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SLC22A8-205ENST00000535878 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC141257.1-202ENST00000570288 2239 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ZNF330-201ENST00000262990 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PAX8-201ENST00000263334 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 OR52M1-201ENST00000360213 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AAMDC-211ENST00000533193 606 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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