Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 GZF1-201ENST00000338121 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 SPATA18-201ENST00000295213 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 TRAF3IP3-203ENST00000367025 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 ATP2C2-201ENST00000262429 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 KIF18BP1-201ENST00000567585 2264 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 AC092159.2-201ENST00000445418 1943 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 MRVI1-215ENST00000541483 2468 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 AC106799.1-201ENST00000503188 1676 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 LYPD4-201ENST00000343055 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 AL356417.2-201ENST00000419064 395 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 LINC00337-202ENST00000441724 1138 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 GNGT2-202ENST00000503070 522 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 RCC2P4-201ENST00000513160 1042 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 FAXDC2-205ENST00000517938 1203 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 ELOBP2-201ENST00000526184 355 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 FAU-206ENST00000529259 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 AC008915.2-201ENST00000570080 730 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 LYPD4-202ENST00000601246 1076 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 AP003973.2-201ENST00000604700 499 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 AL157791.2-201ENST00000604758 478 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 162 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 AL031601.2-201ENST00000622823 457 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 PAMR1-205ENST00000611014 2613 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 AC068669.1-201ENST00000623793 2228 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 PMEPA1-205ENST00000395816 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 ZNF800-202ENST00000393312 2375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 TSPYL2-201ENST00000375442 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 TTC16-201ENST00000373289 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 FCGR1A-201ENST00000369168 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 ZNF766-202ENST00000593612 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 FP475955.3-201ENST00000623678 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 MESD-206ENST00000561312 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 ARL4A-203ENST00000396663 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 WNT4-201ENST00000290167 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 MSR1-205ENST00000445506 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 ZNF548-201ENST00000336128 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 GSTM5-201ENST00000256593 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 SNAPC5-202ENST00000316634 1002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 CLCC1-207ENST00000369976 2468 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 C9orf116-203ENST00000371791 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 AL031663.2-201ENST00000417630 355 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 TRERNA1-201ENST00000431460 462 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 CD59-205ENST00000437761 758 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 RN7SL728P-201ENST00000464718 300 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 RN7SL521P-201ENST00000488398 297 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 AC091057.1-201ENST00000501830 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 RPL34-207ENST00000506397 549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 AC090192.2-201ENST00000517482 553 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 PXN-AS1-205ENST00000542314 707 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 CHORDC2P-201ENST00000557601 1090 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 DHRS4L1-201ENST00000558293 855 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 AC066612.1-203ENST00000560623 481 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 AC027373.1-201ENST00000564694 1142 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 AC104996.2-201ENST00000583091 1000 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 MIR4761-201ENST00000585066 82 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 AC011444.2-201ENST00000587759 567 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 AC147067.2-201ENST00000608161 289 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 AC093323.2-201ENST00000632154 976 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCNN1GP51170 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms