Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CHEK1-203ENST00000428830 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MMP19-201ENST00000322569 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ARHGAP44-201ENST00000262444 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AP001360.1-203ENST00000524708 464 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AL139317.1-201ENST00000554548 196 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TSHZ3-202ENST00000558569 441 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CASP3-206ENST00000523916 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 FAM156A-203ENST00000611661 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PLA2G4C-201ENST00000354276 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 POM121B-201ENST00000380760 2487 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 LINC01597-201ENST00000380888 4472 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DCAKD-202ENST00000342350 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 NKIRAS1-205ENST00000421515 2018 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ZNF567-202ENST00000536254 2825 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 EXOC1-203ENST00000381295 3551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CACNB4-209ENST00000534999 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MYF5-201ENST00000228644 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CUL7-201ENST00000265348 5254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 KCNQ3-204ENST00000521134 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DLGAP1-AS5-202ENST00000565811 2594 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PSAT1-202ENST00000376588 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 RIPOR1-203ENST00000422602 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 COG6-204ENST00000455146 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 C10orf128-201ENST00000374148 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 HIPK1-AS1-204ENST00000450706 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PARP8-219ENST00000514067 2829 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TACC2-206ENST00000368999 3879 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ABCG1-206ENST00000398457 3119 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ARNT2-201ENST00000303329 6558 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ACIN1-223ENST00000605057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DDR1-223ENST00000324771 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CXorf56-201ENST00000320339 2372 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AL512310.7-201ENST00000547785 2268 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DNAJB14-205ENST00000442697 6075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 GPR119-201ENST00000276218 1008 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PHLDB1-217ENST00000530708 874 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MAF1-204ENST00000532522 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 SELENOP-214ENST00000514985 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 LIPC-AS1-201ENST00000561083 2231 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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