Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms