Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
TRAPPC8Q9Y2L5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms