Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIKFYVEQ9Y2I7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms