Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNH4Q9UQ05 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNH4Q9UQ05 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNH4Q9UQ05 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNH4Q9UQ05 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNH4Q9UQ05 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNH4Q9UQ05 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNH4Q9UQ05 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNH4Q9UQ05 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNH4Q9UQ05 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNH4Q9UQ05 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNH4Q9UQ05 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNH4Q9UQ05 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNH4Q9UQ05 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNH4Q9UQ05 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNH4Q9UQ05 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNH4Q9UQ05 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNH4Q9UQ05 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNH4Q9UQ05 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNH4Q9UQ05 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNH4Q9UQ05 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNH4Q9UQ05 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNH4Q9UQ05 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNH4Q9UQ05 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNH4Q9UQ05 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNH4Q9UQ05 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNH4Q9UQ05 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNH4Q9UQ05 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNH4Q9UQ05 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNH4Q9UQ05 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms