Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN88

GABRQ, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRQQ9UN88 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRQQ9UN88 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRQQ9UN88 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRQQ9UN88 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRQQ9UN88 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRQQ9UN88 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRQQ9UN88 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRQQ9UN88 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRQQ9UN88 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRQQ9UN88 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRQQ9UN88 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRQQ9UN88 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRQQ9UN88 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRQQ9UN88 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRQQ9UN88 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRQQ9UN88 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRQQ9UN88 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRQQ9UN88 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRQQ9UN88 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms