Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
GJD2Q9UKL4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJD2Q9UKL4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms