Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MLH3Q9UHC1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
MLH3Q9UHC1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms