Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF1Q9UH73 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms