Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NKX1-2Q9UD57 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms