Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APEX2Q9UBZ4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms