Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS29Q9UBQ0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VPS29Q9UBQ0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 590.2 ms