Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL9Q9P2J3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL9Q9P2J3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL9Q9P2J3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL9Q9P2J3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL9Q9P2J3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL9Q9P2J3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL9Q9P2J3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL9Q9P2J3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL9Q9P2J3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL9Q9P2J3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL9Q9P2J3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL9Q9P2J3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL9Q9P2J3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms