Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPZ2Q9P299 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPZ2Q9P299 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPZ2Q9P299 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPZ2Q9P299 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPZ2Q9P299 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ2Q9P299 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms