Protein–RNA interactions for Protein: Q9P202

WHRN, Whirlin, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHRNQ9P202 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHRNQ9P202 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHRNQ9P202 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHRNQ9P202 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHRNQ9P202 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHRNQ9P202 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHRNQ9P202 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHRNQ9P202 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHRNQ9P202 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHRNQ9P202 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHRNQ9P202 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHRNQ9P202 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHRNQ9P202 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
WHRNQ9P202 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
WHRNQ9P202 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WHRNQ9P202 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WHRNQ9P202 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WHRNQ9P202 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms